Amygdala, beynin limbik sisteminde bulunan, badem şeklinde bir çift yapıdır. İki yarıkürede de bulunan bu yapılar, duyguların, özellikle de korku ve endişe gibi olumsuz duyguların işlenmesinde önemli bir rol oynar. Amygdala ayrıca sosyal davranış, öğrenme ve hafıza süreçlerine de katkıda bulunur.
Amygdala, beyindeki diğer bölgelerle geniş bir ağ oluşturarak iletişim kurar. Özellikle hipotalamus ve hipokampus gibi beyin alanlarıyla yakından ilişkilidir. Stresli veya tehlikeli durumlarla karşılaştığında, amygdala, vücudun „savaş ya da kaç“ tepkisi olarak da bilinen sempatik sinir sistemi aktivasyonunu tetikleyen bir sinyal gönderir. Bu, kalp atış hızının artması, terleme ve kasların gerilmesi gibi fizyolojik tepkilerle sonuçlanır.
Bu, bir çift olarak ortaya çıkan temproral lobun medial (orta) kısmında 13 ayrı çekirdekten oluşan beynin çekirdek alanıdır. Kesin olarak belirlemek istersek, bir amigdala değil, iki amigdala vardır. Çekirdek alan beyindeki çekirdeklerin toplamından meydana gelir. Bu da sinir hücresi gövdelerinin (somata) toplanması ile meydana gelen kümelenmeleridir. Badem çekirdeği olarak da bilinen amigdala, anıları koku veya tat gibi haz verici bilgilerle birleştirir. Limbik sistem de önemli ölçüde hangi amigdala da bir parçası olduğu ile ilgilenir.
Duygusal ifadeler, saldırgan davranışlar ve işleme açısından daha duygusal ilgili anılar. Bu nedenle amigdala duygusal hafıza, hafıza ve duyguların ilişkisi üzerinde önemli bir etkiye sahiptir. Basitçe söylemek gerekirse, amygdala olayları duygulara bağlar ve saklar. Zamanla, uyaranları tehlikeli olarak değerlendirmek için tetikleyici eşik azalmaya devam eder, bu da genellemeye yol açar. Örneğin, genel anksiyete bozukluğu durumunda.
Fizyolojik olarak, buna amigdalanın aşırı uyarılması eşlik eder. Gerçek yada algılanan bir olayı bir tehlike ile ya da acı, ıstırap ile benzer durumlar, objektif olarak karşılaştırılabilir olup olmadıklarına bakılmaksızın, güçlü bir somatik reaksiyonu ( örneğin panik, bulantı, ilgisizlik, bayılma) tetikleyebilir. Hatta orijinal olayın (bilinçli) bir hafızası olup olmadığına bakılmaksızın, beden hafızası terimi genellikle bu bağlamlarda görülür. Bu sıklıkla yaşanan dramatik durumların yeniden yaşanması durumuna tetikleyen yada tetikleyiciler denir. Badem çekirdeği (amygdala) beyin sapı ile çok güçlü bağlantılar içindedir. Örneğin, nefes almayı ve kan dolaşımını etkiler ve bunmların işlevlerini ilgili iç ve dış koşullara göre uyarlar. Duygusal bir amplifikatör gibi davranır, ilgili kaygının gelişmesinde önemlidir. Duygusal değerlendirme ve tanımada ve ayrıca hipotalamus ile adrenal bezlerde anrenalin üretimi yoluyla olası tehlikelerin ve kontrollerin analizinde önemli bir rol oynar.
Basitçe söylemek gerekirse, amigdala iç ve dış ortamdan gelen bilgileri işler ve buna karşılık gelen vejetatif reaksiyonları başlatır. Bu fonksiyonun bir parçası olarak, beş duyunun da izlenimlerinin işlenmesinde ve refleks kontrolünde yer almaktadır. Amigdala, etkiler ve duyumlar gibi algılanan her uyarılmanın sorumluluğunu paylaşır ve muhtemelen cinsel dürtüde de rol oynar.
Amigdalada hasar oluşabilir; otizm, depresyon, fobiler veya narkolepsi gibi hastalıklar bu hasardan kaynaklıdır. Amigdala tamamen başarısız olursa, korku ve korku hissetme ve böylece hayati uyarı ve savunma tepkileri gibi işlevler kaybolur.